Responde al modelo de iglesia jesuítica de tres naves con testero plano. La nave central es más ancha y de mayor altura que las laterales, dedicadas a capillas.
Su aspecto actual en su mayor parte se debe al legado dejado por el presbítero criptanense Joseph Arias Jamones, que posibilitó realizar las obras de reforma de principios del siglo XVIII.
Es sorprendente la variedad de soluciones arquitectónicas empleadas en sus bóvedas de cañón con lunetos en la nave central; en el crucero cúpula de grandes dimensiones sobre pechinas coronada por una linterna para permitir la iluminación del interior; en las capillas de las naves laterales cúpulas sobre pechinas, de arista y elípticas, todas ellas caracterizadas por la armonía de sus proporciones y la elegancia de sus formas y elementos decorativos.
Las bóvedas laterales cuentan con decoración pictórica, en tanto que el presbiterio muestra en su zócalo azulejos –en buena parta perdidos- de tipo talaverano del siglo XVIII.
