El elemento más característico y uno de los más interesantes de Los Cortijos es su superficie natural, al ser el municipio más al norte de la provincia es el que más se aleja de la conocida llanura manchega y el que más se adentra en los Montes de Toledo, con enormes ondulaciones y una distintiva capa forestal plagada de encinas, alcornoques y matorrales, de un verde oscuro intenso.
Sus alrededores son montañosos proporcionando unas peculiares vistas de valles y puertos de vegetación recia, frondosa y espaciada por partes, que diferencia y caracteriza su entorno.
Su término está bañado por numerosos arroyos como el de Valdegutiérrez, de Los Cortijos, de Valdibáñez y de la Velasca, entre otros.